Основное научное направление работы Байкальского музея СО РАН (Листвянка, ул. Академическая, 1) – исследование особенностей эволюции экосистемы Байкала. Многочисленные экспозиции музея представляют разнообразные аспекты лимнологии. В музее 40 аквариумов, 11 из которых – демонстрационного типа, посетители могут увидеть бычков-подкаменщиков, осетра, сига, омуля, хариуса, ленка, тайменя, губки, амфиподы и нерп. Живой мир Байкала можно рассмотреть с помощью микроскопов и компьютерной техники. Круглый год в режиме on-line ведется трансляция дна Байкала (на глубине 5 м и 200 м) и трансляция истока Ангары. В дендропарке «Каменушка» при музее представлены характерные для Байкальского региона растения, в том числе и редкие.